自清洗過濾和發沖洗過濾器的過濾原理不一樣。
1、自清洗過濾器過濾原理：
液體從進口流入，帶補償的刮刀緊貼于濾網內表面，液體通過濾網從濾元內表面向外流動，雜質被截留在內表面，液體從出口流出；隨著時間的推移，雜質逐漸增多，壓差上升，按設定壓差或定時清洗濾網。電機驅動刮刀做水平旋轉運動清洗濾網，刮刀旋轉時雜質被刮刀刮除順濾網流到過濾器底部，大比重雜質沉淀到集污腔。每次清洗由數次沖程組成，濾網表面清洗后，恢復過濾能力。清洗時正常過濾，流量不中斷。多個清洗周期后，雜質積聚到一定量，定期打開排污閥，排出含高濃度雜質的廢液，如需要，也可回收。
2、反沖洗過濾器過濾原理：
液體從過濾器進口流入，部分液體直接從濾元下端進入過濾器，另一部分從中間分流管中進入過濾器頂部后，再從濾網上端流入，液體從濾網上下開口同時流入，透過濾網內表面在出口匯集流出。顆粒雜質被攔截在濾網內表面，累積成濾餅，使進出口之間壓差逐漸變大，表明濾餅達到厚度，此時濾網通量逐漸減小。當達到設定壓差或時間，自清洗動作啟動，減速電機驅動反沖洗轉臂對準一支或一組濾網，濾網上端被封住，下端連接到清洗吸嘴，打開反沖洗閥，將濾網與排污管接通，濾網外側與排污口之間的壓差驅使濾出清液反向流動沖洗濾網內表面濾餅，并排入排污管道。一支/組濾元反沖洗完畢后，關閉反沖洗閥，清洗轉臂對準下一支/組濾網進行反沖洗。濾網被逐支/組反沖洗后，整個過程完成。
3、過濾液體不一樣。
內刮式自清洗過濾器可適用多種液體，如：水、樹脂、涂料、聚合物、粘合劑、檸檬酸、發酵液、殼聚糖、化妝品、瓊脂糖（凝膠）、硅樹脂溶液、肥皂、山梨醇、類固醇、谷物糖漿、濕部助劑、顏料、潤滑劑、橡膠、乙醇、混合油、食用油高溫油、果汁、柴油等。
反洗過濾器則無法適應高粘度液體，只適用于水的過濾，如地下水、海水、湖水、水庫水、循環冷卻水、冷凍水、噴淋水、熱交換水、密封水、軸承冷卻水、油井注水、工藝循環水、機加工冷卻劑、清洗水等。
自清洗過濾器和反沖洗過濾器的選擇，應根據物料的特性選擇不同形式的自清洗過濾器，反沖洗過濾器適合地粘度液體的過濾，高粘度或固含量高的則需要選擇其它形式的自清洗過濾器，反沖洗過濾器不適合。
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